Normalien, diplômé de Sciences-Po Paris, Jérôme Filippini est un ancien élève de l’ENA (1996, promotion Victor Schoelcher). Nommé auditeur à la Cour des comptes en 1996, il devient secrétaire général adjoint de cette institution en 1999, avant d’être secrétaire général de la préfecture du Tarn-et-Garonne, de 2001 à 2003. Il rejoint alors la direction de la logistique à la préfecture de police de Paris, où il met en place et dirige la sous-direction de l’administration et de la modernisation jusqu’en 2006. Sous-directeur de l’organisation et du fonctionnement des services déconcentrés à la direction de l’administration pénitentiaire, au ministère de la justice, puis avocat général à la Cour des comptes pendant deux ans, de septembre 2007 à juillet 2009, il prend, de 2009 à 2011, la direction des systèmes d’information et de communication du ministère de l’intérieur. Il est actuellement directeur, adjoint au secrétaire général du Gouvernement et directeur interministériel des systèmes d’information et de communication.